Schema di cuncepimentu è suluzione di a catena polipeptidica

I. Riassuntu
I Peptidi sò macromoleculi spiciali chì e so sequenze sò inusual in e so caratteristiche chimiche è fisiche.Certi peptidi sò difficiuli di sintetizà, mentri àutri sò relativamente faciuli di sintesi, ma difficiuli di purificà.U prublema pratica hè chì a maiò parte di i peptidi sò ligeramente solubili in suluzioni aqueous, cusì in a nostra purificazione, a parte currispundente di u peptide idrofobu deve esse dissoluta in solventi non-aqueous, Per quessa, sti solventi o tamponi sò prubabile di esse severamente inconsistenti cù l'usu. di prucedure spirimintali biulogica, cusì chì i tecnichi sò strettamente pruibiti di utilizà u peptide per i so propiu scopi, cusì chì e seguenti sò parechji aspetti di u disignu di peptidi per i circadori.

Schema di cuncepimentu è suluzione di a catena polipeptidica
Siconda, a scelta curretta di peptidi difficili sintetici
1. Lunghezza tutale di e sequenze regulate
Peptidi di menu di 15 residui sò più faciuli d'ottene perchè a dimensione di u peptide aumenta è a purità di u pruduttu crudu diminuite.Siccomu a durata tutale di a catena peptidica aumenta oltre 20 residui, a quantità precisa di u produttu hè una preoccupazione chjave.In parechji esperimenti, hè faciule d'ottene effetti inaspettati calendu u numeru di residui sottu à 20.
2. Diminuite u numeru di residui idrofobi
Peptidi cù una grande predominanza di residui idrofobici, in particulare in a regione 7-12 residui da u C-terminale, generalmente causanu difficultà sintetiche.Questu hè vistu cum'è una cumminazione inadegwata precisamente perchè un fogliu B-fold hè ottenutu in a sintesi."In tali casi, pò esse utile per cunvertisce più di dui residui pusitivi è negativi, o di mette Gly o Pro in u peptide per sbloccare a cumpusizioni di peptide".
3. Downregulation di residui "difficili".
"Ci hè una quantità di residui Cys, Met, Arg è Try chì generalmente ùn sò micca facilmente sintetizzati".Ser serà tipicamente utilizatu cum'è alternativa non oxidativa à Cys.
Schema di cuncepimentu è suluzione di a catena polipeptidica

Terzu, migliurà a scelta curretta di soluble in acqua
1. Aghjustate u terminu N o C
Riguardu à i peptidi acidi (vale à dì, carica negativamente à pH 7), l'acetilazione (acetylation N-terminale, C terminus sempre mantenendu un gruppu carboxyl liberu) hè particularmente cunsigliatu per aumentà a carica negativa.In ogni casu, per i peptidi basi (vale à dì, carica positivamente à pH 7), l'aminazione (gruppu amminicu liberu à u N-terminale è l'aminazione à u C-terminale) hè particularmente cunsigliatu per aumentà a carica positiva.

2. Accurtà assai o allargà a sequenza

Alcune di e sequenze cuntenenu un gran numaru di aminoacidi idrofobichi, cum'è Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr è Ala, etc. Quandu questi residui idrofobi superi u 50%, sò generalmente micca faciuli di dissolve.Pò esse utile per allargà a sequenza per aumentà ancu i poli pusitivi è negativi di u peptide.A seconda opzione hè di downregulate a dimensione di a catena di peptide per aumentà i poli pusitivi è negativi per downregulating i residui idrofobici.U più forte i lati pusitivi è negativi di a catena di peptide, u più prubabile di reagisce cù l'acqua.
3. Mettite in un residu soluble in acqua
Per certi catene di peptide, a cumminazzioni di qualchi aminoacidi pusitivi è negativi pò migliurà a solubilità in acqua.A nostra cumpagnia ricumanda u N-terminale o C-terminale di peptidi acidi per esse cumminati cù Glu-Glu.U terminu N o C di u peptide basicu hè statu datu è dopu Lys-Lys.Se u gruppu incaricatu ùn pò micca esse piazzatu, Ser-Gly-Ser pò ancu esse piazzatu in u terminal N o C.Tuttavia, stu approcciu ùn hè micca travagliatu quandu i lati di a catena di peptide ùn ponu esse cambiati.